如果被法院认定证据不合法，那么该证据通常不会被采信。这主要是基于法律对于证据合法性的严格要求和程序正义的保障。
首先，证据的合法性是法院采信证据的前提。在司法实践中，证据的合法性主要涉及以下几个方面：
作证主体合法：根据《中华人民共和国刑事诉讼法》第六十二条，不能正确表达意志的人，不能作为证人。因此，如果证人的作证资格存在瑕疵，那么其提供的证言就可能被视为来源不合法。取证程序合法：证据的收集必须符合法定程序。如果取证过程中存在威胁、欺骗、引诱等非法手段，或者侵犯了他人的合法权益（如隐私权、商业秘密等），那么所获取的证据就可能被视为来源不合法。
证据表现形式合法：证据必须符合法律规定的表现形式。例如，书证应当提供原件，物证应当提供原物等。如果证据的表现形式不符合法律规定，那么这样的证据就可能被视为来源不合法。证据要件合法：某些证据需要满足特定的法律要件才能被采纳。例如，鉴定意见需要由具有法定资质的鉴定机构出具，勘验笔录需要由法定人员进行勘验等。如果证据的要件不符合法律规定，那么这样的证据就可能被视为来源不合法。
其次，法院在采纳证据时必须遵循严格的程序。未经法庭质证的证据不能作为法院裁判的依据。这是因为没有经过质证的证据，其证明力和可信度是值得怀疑的。同时，这也是为了充分保障和尊重当事人的举证、质证权利。
最后，如果法院采纳了不合法的证据，这可能构成程序违法。程序违法是指裁判过程违反法律规定的诉讼程序，这将损害当事人的合法权益，破坏司法公正。在这种情况下，当事人可以通过上诉、申诉等法律途径维护自己的权益。
综上所述，如果被法院认定证据不合法，那么该证据通常不会被采信。法院在审判过程中会严格审查证据的合法性，以确保审判的公正性和合法性。
